最好的临床试验设计方案和诊断技术是使抗感染药物研发迈入正确方向的第一步。但是专家表示，许多制药企业需要重返抗生素制造领域。因为最近几年来，诸如礼来和赛诺菲-安万特公司等抗感染药物领域的先锋相继离开了该领域。虽然小型公司正在竭尽所能对有希望的候选药物进行筛选，但是他们经常需要借助大型制药公司的资源来使这些候选药物进入临床试验并最终推向市场。Levy表示，“我们已经创造性地使大型制药企业重新进入这项竞赛，虽然小型的生物医药公司正在填补这一空缺。”

美国感染疾病学会还就抗感染药物的研发提出了如下3条建议，包括了责任保护、专利延长和提高政府采购承诺。今年9月，国会已经将孤儿药物的奖金和资助从2500万美元增长至3000万美元。虽然这些资助还有没有下发，但是美国感染疾病学会希望抗感染药物的研发也能获得类似的资助。

寻找更多的候选药物

生物技术企业和制药企业对抗感染药物的研发正积极地向获得更多候选药物方面转移。特别是在20世纪90年代中期，许多公司转向通过对化合物库中的化合物进行高通量筛选，从而发现新型抗感染药物的靶点。强生公司的微生物学家Karen Bush说，虽然他们识别了许多新的靶标，但是这种方法没有成功。她说：“新识别的靶标中除了一个进入Ⅰ期临床之外，再也没有任何一只药物进入临床试验阶段。这结果让人相当失望和泄气。”因此，许多公司已经开始以更传统的方法取代高通量筛选。

Cubist制药正在全球范围内收集评估的天然药物的样本。但是正如Eisenstein指出的那样，天然产品的筛选是人力密集型的，而且现实情况是：结得越低的果实越容易被人摘取。

Cubist和其他公司正在重新光顾老的化合物，对其进行修饰，寻找新的克服耐药的方法。例如，全球第一种甘氨酰环素——四环素的半合成衍生物，是由惠氏公司开发的替加环素（tigecycline 、Tygacil），其被证明，其被证明对四环素耐药的革兰氏阳性和革兰阴性菌有效。Cerexa和强生公司正在合作开发一种用于抗MRSA感染的广谱头孢，目前已经进入Ⅲ期临床。
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