围绕种子种苗、疫苗兽药、饲料及添加剂、蜂产品与功能食品等生产技术，积极发展高新技术产业，新组建各类科技型企业32个，其中注册资本3000万元以上的5个，取得各类注册商标38个，拥有各种特许生产经营权证书27个，22个企业取得了高新技术企业资格认证，全院科技产业累计实现产业收入25亿元，收入年均增长28%，纯利润年均增长7%，促进了农业高新技术的中试和转化，科技产业开始步入规模化的稳定发展轨道。
6、基础设施与科研条件逐步改善
建成了“中日农业技术研究发展中心”、“农作物基因资源与基因改良国家重大科学工程”等重大项目；完成了农产品质量标准与质量检测中心、生物安全四级实验室和国家口蹄疫参考实验室的项目设计；新建成或在建国家级重点实验室3个，部门重点开放实验室8个、国家农作物改良（育种）中心6个、改良分中心1个、国家级野外台站5个、部门重点野外台站20个、工程技术研究中心1个、部门农产品质量检测中心26个；科技图书文献保障能力增强，建立了NIAS农业科技文献信息集成平台；建成中国农业科学院（万庄）国际农业高新技术产业园，完成2000亩规模的核心区规划和一批基础设施项目。基本建设总投资达15.4亿元，新增科研专用仪器设备1.1万台（套），价值2.16亿元，分别较“九五”增长0.5倍、2.4倍和1.8倍，为科学技术创新提供了较有力的条件保障。
7、国际合作与交流网络基本形成
新设立4个国际组织和外国机构的亚太区域、国家或项目办事处，“十五”末依托我院设立的国际组织和外国机构办事处总数达到11个；积极开拓南美洲、亚洲周边国家、非洲及中东地区的合作渠道，与世界上60多个国家及20多个国际组织和农业研究机构建立了广泛的科技合作关系，签订科技合作协议55份；新引进各种资源15000余份，项目658个，已覆盖到全国20多个省（市、自治区）的农业科教单位，形成了一定规模的农业科技国际协作网；主办或承办各种大型国际学术会议51次，接待外国官员及专家来访3700多人次，向国外派出专家3000多人次，为促进我院的人才培养和科技创新能力建设发挥了重要作用，国际合作与交流中心的地位逐渐显现。
（四）存在的问题
当前，制约我院发展的深层次矛盾和主要挑战有：一是一些体制性障碍急需通过进一步深化改革解决；二是学科建设和自主创新能力亟待进一步提高；三是领衔科学家和创新团队建设需要进一步加强；四是科研基础设施与条件建设需要一个大的发展；五是系统的国际化战略有待建立，国际科技合作与交流的广度和深度有待拓展；六是社会公益类现代院所制度体系有待完善；七是组织全国农业科研协作的新机制有待进一步探索。
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